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什么是非接觸式超聲波DNA打斷儀

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   非接觸式超聲波DNA打斷儀(non-contact ultrasonic DNA shearing instrument)是一種常用于生物學(xué)和分子生物學(xué)實驗室中的設(shè)備。它可以將高分子DNA分子通過超聲波振動將其打斷成小片段,這些小片段可用于下游分析,如基因組測序、DNA片段分析等。

  傳統(tǒng)的DNA打斷儀(即破碎儀)以接觸式打斷儀為主,在安全性、精密度、反應(yīng)效率、反應(yīng)邊界條件和反應(yīng)均勻度方面存在一定的不足,難以滿足實驗種類的多樣性、安全性、多通道、防病毒交叉感染等要求。

  非接觸式超聲波DNA打斷儀采用非接觸式超聲波粉碎技術(shù),適用于具有特殊需要的反應(yīng)體系,與傳統(tǒng)接觸式打斷儀相比,在安全性、精密度、反應(yīng)效率、反應(yīng)邊界條件和反應(yīng)均勻度等方面均表現(xiàn)突出的優(yōu)勢,已經(jīng)成為CHIP(染色質(zhì)免疫共沉淀)研究平臺的標(biāo)準(zhǔn)化工具。

  非接觸式超聲波DNA打斷儀采用等溫、非接觸的方式對樣品進(jìn)行打斷、勻漿和混合,用于無菌、可超微量破碎,隔著離心管能打斷染色體。

  該儀器通過壓電轉(zhuǎn)換器,將電信號轉(zhuǎn)變?yōu)楦哳l聲波信號,產(chǎn)生數(shù)百萬的水分子”空穴”,利用“空穴” 在幾微秒內(nèi)變大、破裂產(chǎn)生的瞬時流體剪切力,通過等溫、非接觸的方式對樣品進(jìn)行打斷、勻漿和混合。

  專為二代測序DNA樣本與染色質(zhì)免疫共沉淀實驗樣本前處理量身訂做,對于每天要處理多個樣品或者貴重樣品的實驗室,它具有處理高通量,樣本低損耗,無交叉污染等優(yōu)勢。

 

  產(chǎn)品優(yōu)點:

  一次可同時檢測多個樣品,實驗效率高;無需頻繁操作探頭,各樣品均在單獨的全封閉試管中,避免交叉污染;可選配(-20~100度)低溫恒溫槽,便于樣品在低溫的水浴狀態(tài)下工作,能量分布均勻,超聲作用完quan;超聲參數(shù)設(shè)置靈活,實驗步驟標(biāo)準(zhǔn)化,實驗重復(fù)性好,結(jié)果可靠性高。

 

 

  應(yīng)用范圍:

  1.基因組學(xué)研究:在基因組學(xué)研究中,需要對大量的DNA樣本進(jìn)行處理,以獲取高質(zhì)量的DNA樣品。使用非接觸式超聲波DNA打斷儀可以快速、準(zhǔn)確地將DNA打斷為合適長度,從而提高基因組測序的效率和精度。

  非接觸式超聲波DNA打斷儀在基因編輯領(lǐng)域的應(yīng)用

  a.DNA 片段化處理:

  構(gòu)建基因文庫:在構(gòu)建基因文庫時,需要將長鏈 DNA 分子打斷成特定長度的片段。非接觸式超聲波 DNA 打斷儀可以精確、高效地將 DNA 打斷成大小均勻的片段,滿足基因文庫構(gòu)建對 DNA 片段長度的要求,為后續(xù)的基因克隆、篩選等操作提供高質(zhì)量的 DNA 片段。例如,在二代測序技術(shù)中,需要將 DNA 片段化為特定長度(如 200bp 左右)的小片段,以便進(jìn)行測序,儀器能夠很好地完成這一任務(wù)。

  輔助基因編輯工具的導(dǎo)入:一些基因編輯技術(shù),如 CRISPR-Cas9 系統(tǒng),需要將特定的核酸片段(如 sgRNA 和 Cas9 蛋白的編碼基因)導(dǎo)入細(xì)胞內(nèi)。在導(dǎo)入之前,對這些核酸片段進(jìn)行適當(dāng)?shù)钠位幚砜梢蕴岣邔?dǎo)入效率。非接觸式超聲波 DNA 打斷儀可以將這些核酸片段打斷成合適的大小,有利于它們進(jìn)入細(xì)胞并發(fā)揮基因編輯作用。

  b.制備基因編輯的模板:在進(jìn)行基因編輯實驗時,需要制備含有特定突變或修飾的 DNA 模板。該儀器可以對野生型 DNA 進(jìn)行打斷,然后通過后續(xù)的連接、修復(fù)等操作,引入所需的突變或修飾,從而制備出用于基因編輯的模板。例如,在研究特定基因的功能時,可以利用該儀器制備出帶有特定基因突變的 DNA 模板,然后將其導(dǎo)入細(xì)胞或生物體中,觀察基因功能的變化。

  c.染色質(zhì)免疫共沉淀(ChIP)實驗:ChIP 實驗是研究蛋白質(zhì)與 DNA 相互作用的重要方法。在該實驗中,需要將染色質(zhì)打斷成小片段,以便后續(xù)的免疫沉淀和分析。非接觸式超聲波 DNA 打斷儀可以在不接觸樣品的情況下,對染色質(zhì)進(jìn)行均勻的打斷,避免了傳統(tǒng)方法中可能出現(xiàn)的交叉污染和樣品損失等問題,為 ChIP 實驗提供高質(zhì)量的染色質(zhì)片段91113。

  d.細(xì)胞內(nèi)基因編輯:由于非接觸式超聲波 DNA 打斷儀可以隔著離心管打斷染色體,因此可以用于細(xì)胞內(nèi)的基因編輯操作。它可以在不損傷細(xì)胞的情況下,將外源的基因編輯工具(如 CRISPR-Cas9 系統(tǒng))導(dǎo)入細(xì)胞內(nèi),并對細(xì)胞內(nèi)的 DNA 進(jìn)行精確的編輯,為細(xì)胞內(nèi)基因編輯提供了一種高效、安全的方法。

  e.基因治療研究:在基因治療領(lǐng)域,需要將治療性的基因片段準(zhǔn)確地導(dǎo)入患者的細(xì)胞內(nèi),以糾正或補(bǔ)償致病基因的功能。非接觸式超聲波 DNA 打斷儀可以對治療性的基因片段進(jìn)行預(yù)處理,使其更容易被細(xì)胞攝取和表達(dá),為基因治療的研究提供了技術(shù)支持。例如,在針對某些遺傳性疾病的基因治療研究中,該儀器可以將攜帶正常基因的 DNA 片段打斷成合適的大小,然后與載體結(jié)合后導(dǎo)入患者的細(xì)胞內(nèi),實現(xiàn)基因的修復(fù)和治療。

  2.分子診斷:在醫(yī)學(xué)領(lǐng)域,它可以用于分析DNA樣本,例如檢測致病基因、診斷遺傳性疾病等。

  3.農(nóng)業(yè)科學(xué):在農(nóng)業(yè)科學(xué)領(lǐng)域,它可以用于切割植物和動物基因組以進(jìn)行分子標(biāo)記研究,同時也可以用于生殖和育種研究。

  4.生命科學(xué):它可用于生命科學(xué)中的各種實驗,如克隆、基因表達(dá)分析、DNA重組、構(gòu)建基因庫等。

  非接觸式超聲波DNA打斷儀是一種非常重要的實驗設(shè)備,在生物學(xué)和分子生物學(xué)領(lǐng)域發(fā)揮著廣泛的作用,并為科學(xué)研究提供了高效、準(zhǔn)確的技術(shù)支持。

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